If anyone is interested, using the command line mode in Clonezilla, I removed the GPT components using gdisk:
# sudo gdisk /dev/sda
GPT fdisk (gdisk) version 0.7.2
Partition table scan:
MBR: MBR only
BSD: not present
APM: not present
GPT: present
Found valid MBR and GPT. Which do you want to use?
1 - MBR
2 - GPT
3 - Create blank GPT
Your answer: 1
Command (? for help): x
Expert command (? for help): z
About to wipe out GPT on /dev/sda. Proceed? (Y/N): y
GPT data structures destroyed! You may now partition the disk using fdisk or
other utilities.
Blank out MBR? (Y/N): n <--- do NOT choose Y!
MBR is unchanged. You may need to delete an EFI GPT (0xEE) partition
with fdisk or another tool.
All working now and Clonezilla runs without errors.
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